INTRODUCCIÓN. BASES DE DATOS BIOLÓGICAS
  • INTRODUCCIÓN
  • ¿QUÉ SON LAS BASES DE DATOS BIOLÓGICAS?
  • TIPOS DE BASES DE DATOS BIOLÓGICAS
  • PRINCIPALES BASES DE DATOS BIOLÓGICAS
  • LAS BASES DE DATOS NCBI Y EBI
  • PRÁCTICA. BASES DE DATOS BIOLÓGICAS
  • CORRECCIÓN PRÁCTICA
  • CUESTIONARIO BASES DE DATOS BIOLÓGICAS
SECUENCIACIÓN Y ENSAMBLADO
  • INTRODUCCIÓN
  • MÉTODOS DE SECUENCIACIÓN
  • EL FORMATO FASTQ
  • ENSAMBLADO DE SECUENCIAS
  • DESCARGA DE LECTURAS EN LA BASE DE DATOS ENA
  • DESCARGA DE LECTURAS EN LA BASE DE DATOS SRA
  • ENSAMBLADO DE LECTURAS CON STADEN (Gap4)
  • PRÁCTICA. ENSAMBLADO CON STADEN (Gap4)
  • CORRECCIÓN PRÁCTICA ENSAMBLADO CON STADEN
  • ENSAMBLADO DE LECTURAS CON UGENE (CAP3)
  • PRÁCTICA ENSAMBLADO CON UGENE (CAP3)
  • CORRECCIÓN PRÁCTICA ENSAMBLADO CON UGENE
  • CUESTIONARIO SECUENCIACIÓN Y ENSAMBLADO
ANOTACIÓN DE SECUENCIAS
  • INTRODUCCIÓN
  • DEFINICIÓN Y TIPOS DE ANOTACIÓN
  • PROMOTORES Y SEÑALES
  • INTRONES Y EXONES
  • OPEN READIGN FRAMES (ORFs)
  • MODELOS OCULTOS DE MARKOV Y ALGORITMO DE VITERBI
  • PREDICCIÓN DE GENES CON FPROM Y GENSCAN
  • PRÁCTICA PROMOTORES E ISLAS CpG (EPD, NNPP y CpGplot)
  • CORRECCIÓN PRÁCTICA PROMOTORES
  • PRÁCTICA PREDICCIÓN DE GENES CON GENSCAN
  • CORRECCIÓN PRÁCTICA GENES
  • PRÁCTICA OPEN READING FRAMES (ORF FINDER)
  • CORRECCIÓN PRÁCTICA ORF
  • ANOTACIÓN FUNCIONAL DE SECUENCIAS CON BLAST2GO
  • PRÁCTICA ANOTACIÓN FUNCIONAL CON PANNZER2
  • CORRECCIÓN PRÁCTICA PANNZER2
  • CUESTIONARIO PREDICCIÓN DE GENES
EN NAVEGADOR GENÓMICO
  • INTRODUCCIÓN
  • GENOMAS, CROMOSOMAS Y GENES
  • ESTUDIO DEL GENOMA CON EMSEMBL
  • PRÁCTICA ENSEMBL: EL GENOMA
  • CORRECCIÓN PRÁCTICA EL GENOMA
  • NAVEGANDO POR LOS CROMOSOMAS CON ENSEMBL
  • PRÁCTICA ENSEMBL: NAVEGANDO POR LOS CROMOSOMAS
  • CORRECCIÓN PRÁCTICA NAVEGANDO POR LOS CROMOSOMAS
  • CUESTONARIO EL NAVEGADOR GENÓMICO
BÚSQUEDA DE DATOS EN EL NCBI
  • INTRODUCCIÓN
  • LA BASE DE DATOS GENBANK
  • LA BASE DE DATOS REFSEQ
  • LA BASE DE DATOS GENE
  • EL FORMATO FASTA
  • BÚSQUEDA DE SECUENCIAS EN EL NCBI
  • BÚSQUEDA DE GENES EN EL NCBI Y SEQUENCE VIEWER
  • PRÁCTICA BÚSQUEDA DE SECUENCIAS EN EL NCBI
  • CORRECCIÓN PRÁCTICA
  • CUESTIONARIO BÚSQUEDA DE DATOS EN EL NCBI
PROTEÓMICA
  • INTRODUCCIÓN
  • CONCEPTOS BÁSICOS SOBRE LAS PROTEÍNAS
  • DETERMINACIÓN DE LA ESTRUCTURA DE LAS PROTEÍNAS
  • BÚSQUEDA DE PROTEÍNAS EN UNIPROT
  • PRÁCTICA PROTEÍNAS CON UNIPROT
  • CORRECCIÓN PRÁCTICA PROTEÍNAS CON UNIPROT
  • DE GENES A PROTEÍNAS CON ENSEMBL
  • PRÁCTICA PROTEÍNAS CON ENSEMBL
  • CORRECCIÓN PRÁCTICA PROTEÍNAS CON ENSEMBL
  • ESTRUCTURA DE PROTEÍNAS CON PDB (1ª parte)
  • ESTRUCTURA DE PROTEÍNAS CON PDB (2ª parte)
  • PRÁCTICA ESTRUCTURA DE PROTEÍNAS (PDB, UNIPROT, SWISS MODEL)
  • CORRECCIÓN PRÁCTICA ESTRUCTURA PROTEÍNAS
  • CUESTIONARIO PROTEÓMICA
ALINEAMIENTOS DE PARES DE SECUENCIAS (PSA)
  • INTRODUCCIÓN
  • ASPECTOS GENERALES
  • DOT- PLOT
  • ALGORITMO DE NEEDLEMAN-WUNSCH
  • ALGORITMO DE SMITH-WATERMAN
  • PSA CON DOTLET
  • PSA CON LALING (EXPASSY)
  • PRÁCTICA PSA. PROGRAMAS NEEDLE Y WATER (EMBOSS)
  • CORRECCIÓN PRÁCTICA PSA
  • CUESTIONARIO ALINEAMIENTOS DE PARES DE SECUENCIAS
LA HERRAMIENTA BLAST
  • INTRODUCCIÓN
  • ALGORITMO BLAST
  • TIPOS DE BLAST
  • BLAST EN EL NCBI
  • PRÁCTICA BLAST
  • CORRECCIÓN PRÁCTICA BLAST
  • CUESTIONARIO HERRAMIENTA BLAST
ALINEAMIENTO MÚLTIPLE DE SECUENCIAS (MSA)
  • INTRODUCCIÓN
  • CONCEPTOS GENERALES
  • MÉTODOS DE ALINEAMIENTO MÚLTIPLE